Hướng dẫn kê khai thuế sàn thương mại điện tử: Chi tiết, dễ hiểu

Bán hàng online trên Shopee, TikTok Shop, Facebook hay website riêng có phải nộp thuế không? Kê khai thuế sàn thương mại điện tử như thế nào để đúng quy định và tránh bị truy thu là thắc mắc của rất nhiều người kinh doanh hiện nay. Trong bài viết này, hãy cùng Phần mềm quản lý bán hàng EasyPOS tìm hiểu chi tiết quy định mới nhất và cách thực hiện đúng theo hướng dẫn của cơ quan thuế.

1. Kinh doanh online có bắt buộc kê khai thuế thương mại điện tử không?

Theo khoản 1 Điều 2 Thông tư 40/2021/TT-BTC, cá nhân và hộ kinh doanh phát sinh doanh thu từ hoạt động kinh doanh trên môi trường số đều thuộc đối tượng thực hiện nghĩa vụ thuế theo quy định.

Điều này đồng nghĩa với việc hộ kinh doanh cần lưu ý nếu đang tạo doanh thu từ các hình thức sau:

• Bán hàng trên sàn thương mại điện tử: Shopee, Lazada, Tiki, Sendo và các nền tảng tương tự.
• Kinh doanh qua mạng xã hội: Facebook, Zalo, Instagram hoặc các nền tảng social commerce khác.
• Nền tảng nội dung và dịch vụ số: Google, YouTube, TikTok, App Store, CH Play… có phát sinh thu nhập từ quảng cáo, tiếp thị liên kết hoặc cung cấp dịch vụ.
• Website hoặc ứng dụng bán hàng riêng: Hộ kinh doanh tự vận hành website/app và có doanh thu từ hoạt động bán sản phẩm, dịch vụ.

Không chỉ nhằm đáp ứng yêu cầu pháp lý, việc kê khai thuế đầy đủ còn giúp hộ kinh doanh nâng cao mức độ minh bạch, tạo niềm tin với đối tác và khách hàng, đồng thời thuận lợi hơn khi mở rộng quy mô kinh doanh sau này.

2. Các nhóm đối tượng kê khai thuế đối với hoạt động bán hàng trên sàn TMĐT

Tùy theo hình thức kinh doanh và phương thức thanh toán, cách kê khai thuế của hộ kinh doanh có thể khác nhau. Dưới đây là những trường hợp thường gặp:

2.1. Hộ kinh doanh bán hàng trên sàn TMĐT tích hợp thanh toán

Trường hợp này áp dụng với các hộ kinh doanh hoạt động trên những sàn TMĐT có chức năng thanh toán như Shopee, Lazada hoặc Tiki. Dữ liệu giao dịch từ các nền tảng này có thể được đồng bộ với hệ thống quản lý của cơ quan thuế.

Theo đó, hộ kinh doanh sẽ thực hiện kê khai và nộp thuế thông qua Cổng thông tin điện tử dành cho hộ, cá nhân kinh doanh TMĐT của cơ quan thuế tại địa chỉ: canhantmdt.gdt.gov.vn.

2.2. Hộ kinh doanh online trên nền tảng không hỗ trợ thanh toán

Đây là trường hợp phổ biến với các hộ bán hàng qua Facebook, Zalo hoặc website riêng, trong đó khách hàng thanh toán trực tiếp bằng chuyển khoản hoặc tiền mặt thay vì thông qua cổng thanh toán của nền tảng.

Khi đó, hộ kinh doanh cần kê khai và nộp thuế trực tiếp tại cơ quan thuế quản lý nơi cư trú hoặc địa điểm đăng ký kinh doanh (bao gồm nơi thường trú hoặc tạm trú).

Hồ sơ kê khai gồm:

Tờ khai thuế dành cho hộ, cá nhân kinh doanh trên nền tảng thương mại điện tử theo Mẫu số 02/CNKD-TMĐT.

Thời hạn nộp hồ sơ thuế:

• Khai theo tháng: Nộp chậm nhất vào ngày 20 của tháng kế tiếp sau tháng phát sinh nghĩa vụ thuế.
• Khai theo từng lần phát sinh: Thời hạn tối đa là 10 ngày kể từ ngày phát sinh nghĩa vụ thuế.

2.3. Hộ kinh doanh kết hợp bán hàng online và cửa hàng trực tiếp

Nhiều hộ kinh doanh hiện nay áp dụng mô hình kết hợp giữa cửa hàng truyền thống và bán hàng trên nền tảng số để mở rộng doanh thu.

Đối với trường hợp này, hộ kinh doanh cần kê khai thuế trên tổng doanh thu thực tế, bao gồm cả nguồn thu từ cửa hàng offline và doanh thu phát sinh từ các kênh online.

Để tránh rủi ro về thuế, hộ kinh doanh nên ghi nhận và kê khai đầy đủ doanh thu của tất cả các kênh bán hàng, đảm bảo tính chính xác và tuân thủ quy định hiện hành.

3. Hướng dẫn tính thuế bán hàng trên sàn TMĐT mới nhất

Đây là nội dung mà các hộ kinh doanh online cần đặc biệt quan tâm khi bán hàng trên sàn thương mại điện tử.

Theo quy định áp dụng từ 01/07/2025, các sàn TMĐT có trách nhiệm khấu trừ và nộp thuế thay cho người bán ngay tại thời điểm giao dịch hoàn tất. Vì vậy, việc hiểu rõ cách xác định doanh thu và mức thuế phải nộp sẽ giúp chủ shop chủ động kiểm soát dòng tiền hiệu quả hơn.

3.1. Cách xác định doanh thu làm căn cứ tính thuế

Theo điểm d khoản 2 Điều 5 Nghị định 117/2025/NĐ-CP, doanh thu dùng để tính thuế là toàn bộ khoản tiền người bán được hưởng do sàn thương mại điện tử thu hộ.

Khoản doanh thu này thường bao gồm:

• Giá trị bán hàng hóa hoặc dịch vụ của đơn hàng.
• Các khoản hỗ trợ, phụ thu hoặc trợ giá mà người bán nhận được.
• Phí giao hàng và các khoản chi phí khác do khách mua thanh toán.

Hiểu đơn giản, doanh thu tính thuế chính là tổng số tiền khách hàng thanh toán cho đơn hàng trước khi khấu trừ bất kỳ khoản phí nào, bao gồm chi phí quảng cáo, phí vận chuyển trả cho đơn vị giao hàng hay giá vốn sản phẩm.

3.2. Công thức tính thuế sàn TMĐT và mức tỷ lệ áp dụng

Đối với hộ kinh doanh bán hàng trên nền tảng thương mại điện tử, số thuế phải thực hiện thường bao gồm thuế Giá trị gia tăng (GTGT) và thuế Thu nhập cá nhân (TNCN). Mức tỷ lệ áp dụng được quy định tại khoản 2 Điều 5 của Nghị định 117/2025/NĐ-CP.

Với hoạt động kinh doanh hàng hóa trên sàn TMĐT, tỷ lệ thuế phổ biến như sau:

• Thuế GTGT: 1% trên doanh thu tính thuế.
• Thuế TNCN: 0,5% trên doanh thu tính thuế.

Công thức xác định số thuế cần nộp:

• Thuế GTGT phải nộp = Doanh thu tính thuế x 1%
• Thuế TNCN phải nộp = Doanh thu tính thuế x 0,5%

Ngoài ra, với một số trường hợp hộ kinh doanh có quy mô doanh thu lớn (trên 3 tỷ), phương pháp tính thuế có thể thay đổi theo hình thức tính trên phần thu nhập chịu thuế sau khi trừ chi phí hợp lệ. 

Khi đó, hộ kinh doanh có thể phải thực hiện quyết toán vào cuối kỳ để xác định chính xác nghĩa vụ thuế, đồng thời phần thuế đã được sàn khấu trừ trong năm sẽ được đối trừ theo quy định hiện hành.

4. Hướng dẫn chi tiết cách kê khai thuế thương mại điện tử hộ kinh doanh

Để giúp hộ kinh doanh thực hiện nghĩa vụ thuế thuận tiện hơn, dưới đây là quy trình kê khai và nộp thuế trực tuyến trên Cổng thông tin điện tử của cơ quan thuế. Hướng dẫn này áp dụng cho cả trường hợp kê khai lần đầu và kê khai bổ sung khi có sai sót hoặc điều chỉnh thông tin.

Bước 1: Truy cập hệ thống kê khai thuế TMĐT

Hộ kinh doanh truy cập Cổng thông tin điện tử dành cho hộ, cá nhân kinh doanh TMĐT tại địa chỉ: canhantmdt.gdt.gov.vn.

Sau đó, người nộp thuế đăng nhập bằng tài khoản định danh điện tử VNeID mức độ 2. Tại bước này, cần nhập thông tin đăng nhập (tên tài khoản và mật khẩu) do Bộ Công an cấp để xác thực trên hệ thống.

Bước 2: Chọn chức năng kê khai thuế thương mại điện tử

Sau khi đăng nhập thành công, người nộp thuế vào mục:

Khai thuế → Kê khai thuế cho hoạt động kinh doanh thương mại điện tử

Lúc này, hệ thống sẽ hiển thị giao diện lựa chọn phương thức kê khai để người dùng tiếp tục thao tác.

Bước 3: Lựa chọn hình thức kê khai phù hợp

Hộ kinh doanh chọn một trong hai phương thức kê khai, gồm:

• Kê khai theo tháng
• Kê khai theo từng lần phát sinh doanh thu

Sau khi lựa chọn, hệ thống sẽ chuyển sang màn hình nhập thông tin tờ khai.

Trường hợp kê khai chính thức

Nếu chọn tờ khai chính thức, người nộp thuế cần nhập doanh thu phát sinh từ hoạt động bán hàng hoặc cung cấp dịch vụ thuộc các nhóm hàng hóa, dịch vụ chịu:

• Thuế tiêu thụ đặc biệt
• Thuế hoặc phí bảo vệ môi trường
• Thuế tài nguyên (nếu có)

Hệ thống sẽ tự động hiển thị bảng thông tin tương ứng để người dùng kê khai.

Sau khi hoàn tất thông tin:

• Chọn “Tiếp tục” để kiểm tra dữ liệu
• Nếu có sai sót, chọn “Quay lại” để chỉnh sửa
• Nếu thông tin đã chính xác, nhập mã Captcha và nhấn “Nộp tờ khai”

Tiếp theo, hệ thống chuyển sang bước xác thực. Người nộp thuế nhập mã OTP gửi về số điện thoại đăng ký, chọn “Tiếp tục” để hoàn tất kê khai.

Trường hợp kê khai bổ sung

Nếu cần điều chỉnh dữ liệu đã gửi trước đó, người nộp thuế chọn tờ khai bổ sung.

Khi đó, hệ thống sẽ hiển thị dữ liệu của tờ khai gần nhất đã được cơ quan thuế chấp nhận trong cùng kỳ tính thuế. Người dùng chỉnh sửa nội dung cần thay đổi, sau đó chọn “Tổng hợp KHBS” để hệ thống tự động lập Bản giải trình khai bổ sung.

Trước khi gửi, cần rà soát kỹ các biểu mẫu sau:

• Tờ khai thuế của hộ/cá nhân kinh doanh
• Bản giải trình khai bổ sung
• Tờ khai điều chỉnh bổ sung

Nếu dữ liệu chính xác, nhập Captcha, nhấn “Nộp tờ khai”, xác thực bằng OTP và hoàn tất quy trình.

Lưu ý khi kê khai bổ sung:

• Nếu số thuế phải nộp trên tờ khai bổ sung thấp hơn số tiền ở tờ khai gần nhất, hệ thống sẽ không hiển thị nút “Nộp thuế ngay”.
• Nếu số tiền phải nộp cao hơn kỳ khai trước, hệ thống sẽ hiển thị nút “Nộp thuế ngay” để người nộp thuế thanh toán phần chênh lệch phát sinh.

Bước 4: Thực hiện nộp thuế trực tuyến

Sau khi hoàn thành kê khai, hộ kinh doanh có thể nộp thuế bằng một trong hai cách:

• Cách 1: Chọn “Nộp thuế ngay” ngay sau khi gửi tờ khai thành công.

• Cách 2: Truy cập mục “Nộp thuế” trên giao diện chính và chọn “Lập giấy nộp tiền”.

Bước 5: Liên kết và chọn tài khoản ngân hàng thanh toán

Người nộp thuế lựa chọn tài khoản ngân hàng hoặc thẻ thanh toán đã liên kết để thực hiện giao dịch.

• Nếu chưa liên kết tài khoản, chọn “Liên kết tài khoản ngay” và thực hiện theo hướng dẫn.
• Nếu đã có tài khoản liên kết trước đó, chỉ cần chọn tài khoản muốn sử dụng rồi nhấn “Tiếp tục”.

Bước 6: Chọn khoản thuế cần nộp

Hệ thống sẽ hiển thị:

• Danh sách khoản phải nộp vào ngân sách nhà nước
• Số tiền cần thanh toán
• Tổng giá trị cần nộp

Người nộp thuế tích chọn khoản thuế tương ứng và nhấn “Nộp thuế”.

Ngoài ra, có thể sử dụng tính năng “Truy vấn” để kiểm tra:

• Thuế còn phải nộp
• Tiền chậm nộp hoặc tiền phạt (nếu có)
• Các khoản thu ngân sách khác đang chờ xử lý

Sau khi kiểm tra, chọn khoản thanh toán → nhấn “Tiếp tục” → “Tạo giấy nộp tiền” → “Nộp thuế” để chuyển sang bước xác thực.

Bước 7: Xác thực giao dịch và hoàn tất nộp thuế

Cuối cùng, người nộp thuế nhập mã OTP do ngân hàng gửi qua SMS hoặc ứng dụng ngân hàng điện tử, sau đó chọn “Xác thực”.

• Nếu mã OTP hợp lệ, hệ thống sẽ hiển thị trạng thái “Thành công”.
• Nếu xác thực thất bại, người dùng quay về Trang chủ và chọn “Tiếp tục nộp thuế” để thực hiện lại giao dịch.

5. Những lưu ý quan trọng khi thực hiện kê khai thuế thương mại điện tử

Việc kê khai thuế thương mại điện tử không chỉ dừng lại ở thao tác nộp tờ khai mà còn đòi hỏi hộ kinh doanh theo dõi sát doanh thu, xác định đúng nghĩa vụ thuế và cập nhật các quy định mới. Để hạn chế sai sót, tránh bị xử phạt hoặc truy thu, hộ kinh doanh cần lưu ý các vấn đề sau:

Xác định đúng đối tượng phải tự kê khai hay được sàn kê khai thay

Nếu bán hàng trên sàn TMĐT có chức năng thanh toán (Shopee, TikTok Shop, Lazada…), sàn có thể thực hiện khấu trừ, kê khai và nộp thuế thay theo quy định. Tuy nhiên, với các kênh không có chức năng thanh toán như Facebook, Zalo, website riêng hoặc nhận tiền trực tiếp, hộ kinh doanh vẫn phải tự kê khai với cơ quan thuế.

Kê khai đúng doanh thu thực tế phát sinh

Doanh thu tính thuế thường được xác định trên tổng số tiền người mua thanh toán, chưa trừ phí sàn, chi phí quảng cáo, phí vận chuyển hoặc giá vốn hàng hóa. Việc khai thiếu doanh thu có thể dẫn đến truy thu và xử phạt hành chính về thuế.

Theo dõi doanh thu từ nhiều kênh bán hàng

Hộ kinh doanh bán đa kênh (online kết hợp cửa hàng trực tiếp, nhiều sàn TMĐT hoặc mạng xã hội) cần tổng hợp đầy đủ doanh thu từ tất cả nguồn phát sinh. Không thể chỉ kê khai doanh thu trên một nền tảng mà bỏ sót doanh thu ở các kênh khác.

Chú ý thời hạn nộp tờ khai và tiền thuế

Việc nộp chậm hồ sơ kê khai hoặc chậm nộp tiền thuế có thể phát sinh tiền chậm nộp, tiền phạt hành chính. Vì vậy, hộ kinh doanh nên chủ động theo dõi lịch kê khai theo tháng hoặc theo từng lần phát sinh để tránh quá hạn.

Kiểm tra kỹ thông tin trước khi gửi tờ khai

Sai mã số thuế, sai doanh thu, sai kỳ tính thuế hoặc nhầm loại hình kê khai có thể khiến hồ sơ bị từ chối hoặc phải kê khai bổ sung. Trước khi nhấn “Nộp tờ khai”, nên rà soát lại toàn bộ thông tin và chứng từ liên quan.

Lưu trữ chứng từ, sao kê và dữ liệu bán hàng đầy đủ

Hộ kinh doanh nên lưu hóa đơn điện tử, lịch sử đơn hàng, sao kê ngân hàng, biên bản đối soát từ sàn TMĐT và chứng từ thanh toán để đối chiếu khi cần giải trình với cơ quan thuế hoặc kê khai bổ sung.

Cập nhật quy định thuế mới từ năm 2026

Từ năm 2026, chính sách quản lý thuế đối với hộ kinh doanh tiếp tục có nhiều thay đổi theo hướng minh bạch doanh thu và tăng cường kê khai điện tử. Do đó, hộ kinh doanh TMĐT nên thường xuyên theo dõi thông báo từ cơ quan thuế để thực hiện đúng quy định hiện hành.

Đặc biệt, hộ kinh doanh có doanh thu dưới 1 tỷ/năm sẽ được miễn 2 loại thuế đó là thuế GTGT và thuế TNCN. 

Tạm kết

Trên đây là toàn bộ thông tin cần biết về kê khai thuế thương mại điện tử dành cho hộ kinh doanh và cá nhân bán hàng online. Hy vọng bài viết từ EasyPOS sẽ là nguồn tham khảo hữu ích, giúp bạn dễ dàng áp dụng vào thực tế và thực hiện nghĩa vụ thuế đúng quy định.